I praksis vil det sige, at kommunen tildeler den selvejende institution det samme beløb, som de kommunale daginstitutioner får til personale og drift, men det er bestyrelsen i den selvejende institution, der står for driften. I fagsproget hedder det en "driftsaftale".
Det er således bestyrelsen, der har ansvaret for driften. For eksempel er det bestyrelsens opgave at ansætte personalet og - naturligvis i samarbejde med den pædagogiske leder og medarbejderne - at udstikke de pædagogiske retningslinjer for institutionen. Alt sammen naturligvis inden for de overordnede rammer, som kommunen og lovgivningen tillader. Kommunen har også tilsynspligt med institutionen.
En selvejende institution kan - modsat en privat institution - ikke trække et eventuelt overskud ud af institutionen eller selv fastsætte forældrebetalingen. Forældrebetalingen er den samme, som i kommunens øvrige daginstitution.